У жеребкуванні брали участь 14 клубів, більша частина з яких стане відомою 26/27 липня, коли завершиться другий відбірковий раунд Ліги чемпіонів.

У цьому раунді Ліги Європи може взяти участь і київське «Динамо», якщо програє у за сумою двох матчів турецькому «Фенербахче» (20 та 27 липня) у відборі Ліги чемпіонів. В такому випадку жереб визначив у суперники команді Мірчи Леческу чеський «Словацко».

Шлях чемпіонів. У третьому кваліфікаційному раунді зіграють 10 команд, які вилетять у другому відбірному раунді Ліги чемпіонів з Шляху чемпіонів.

Основний шлях. Зіграють 2 команди, які вилетять у другому відбірному раунді Ліги чемпіонів з Шляху представників ліг, а також 2 команди, які розпочинають боротьбу в Лізі Європи з третього відбіркового раунду.

Процедура жеребкування. Для Шляху чемпіонів посіву не передбачено, жеребкування було сліпим. Команди, кулі із назвами яких витягнули в парах першими, проведуть перший матч удома. Клуби, які безпосередньо вийшли до третього відбіркового раунду Основного шляху, були сіяними по відношенню до клубів, що вилетіли з Ліги чемпіонів на Шляхи представників ліг за підсумками другого відбіркового раунду.

При жеребкуванні Основного шляху кулі з іменами сіяних команд помістили в одну чашу, з несіяними іменами – в іншу. Після цього обирали по одній кулі з кожної чаші та помістили у чашу посередині. Команди, кулі із назвами яких витягнули з чаші посередині першими, перший матч третього відбірного раунду проведуть удома.

Клуби з однієї асоціації на цьому етапі зустрітися не можуть. Також не могли зустрітися клуби з Вірменії та Азербайджану.

3-й раунд кваліфікації, 4 и 11 серпня

Основний шлях
Динамо Київ (Україна)/Фенербахче (Туреччина) – Словацко (Чехія)
Мідтьюлланд (Данія)/АЕК Ларнака (Кіпр) – Партизан (Сербія)


Шлях чемпіонів
Жальгіріс Вільнюс (Литва)/Мальме (Швеція) – Пюнік (Вірменія)/Дюделанж (Люксембург)
Лудогорець (Болгарія)/Шемрок Роверс (Ірландія) – Динамо Загреб (Хорватія)/Шкупі (Північна Македонія)
Лінфілд (Північна Ірландія)/Буде-Глімт (Норвегия) – Карабах (Азербайджан)/Цюрих (Швейцарія)
Маккабі Хайфа (Ізраїль)/Олімпіакос (Греція) – Ференцварош (Венгрія)/Слован (Словаччина)
Марибор (Словенія)/Шериф (Молдова) – ХІК (Фінляндія)/Вікторія Пльзень (Чехія)

Що далі?
Переможці третього відбіркового раунду Ліги Європи вийдуть до раунду плей-оф Ліги Європи. Ті, хто програють, відправляться в раунд плей-оф Ліги конференцій.